医疗大数据应用技术国家工程实验室的机构设置包括实验室理事会、实验室主任、工程实验室技术委员会、实验室资金管理委员会、实验室业绩考核委员会等部门，具体如图所示。

各部门的职责为：

实验室主任：负责实验室的日常工作。

工程实验室理事会：负责主任的聘任、确定实验室发展方向和重要研究领域、审议和批准财务预决算等重大事项的决策。

工程实验室技术委员会：负责实验室的发展目标、任务、研究方向和技术。

实验室资金管理委员会：负责实验室建设的资金筹集和实验室科研项目经费的预决算。

实验室业绩考核委员会：负责监督科研计划的落实情况，和实验室的业绩考核。

  医疗大数据应用技术国家工程实验室机构设置图